Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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