Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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