Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms