Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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