Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms