Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms