Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms