Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms