Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB1P82279 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB1P82279 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRB1P82279 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms