Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms