Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX6P78412 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms