Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms