Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms