Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms