Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms