Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms