Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms