Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTBP60709 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACTBP60709 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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