Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP7P55210 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP7P55210 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP7P55210 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms