Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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