Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A1P43005 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms