Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms