Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms