Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD34P28906 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD34P28906 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD34P28906 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms