Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms