Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms