Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT1P21579 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT1P21579 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT1P21579 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYT1P21579 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms