Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA1P20827 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms