Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF3P18847 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF3P18847 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF3P18847 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms