Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBTFP17480 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBTFP17480 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBTFP17480 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFP17480 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFP17480 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms