Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAV1P15498 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAV1P15498 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms