Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms