Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF1P10914 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF1P10914 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms