Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPIPA8P0DM63 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms