Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD2P0DJD1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms