Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC166P0CW27 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms