Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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