Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms