Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F13BP05160 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F13BP05160 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F13BP05160 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms