Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRATO95237 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRATO95237 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRATO95237 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms