Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
JRKO75564 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JRKO75564 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JRKO75564 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JRKO75564 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms