Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ABCC9O60706 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms