Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms