Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM6AO15550 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms