Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLOCKO15516 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms