Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNMO15061 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNMO15061 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms