Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE40O14503 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms