Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms