Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA5E9PKD4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms