Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DXG7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DXG7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms